南京大学绿色化学与工程研究院是学校在苏州首批建设的新型研究院之一。研究院面向国家重大战略需求，围绕绿色化工过程、能源化工、智能化工过程等方向，紧密结合苏州市“打造全球高端制造业基地”以及提升绿色低碳循环发展水平的需求，开展高水平、前瞻性应用基础研究以及关键技术攻关，为建立清洁、高效、安全的绿色化工过程提供技术及人才支持。研究院的建设，是学校建设“化学工程与技术”一流学科的战略举措，目标是将研究院建成为具有国际影响的化学工程与技术创新高地和人才培养基地，为苏州市推进绿色制造体系建设贡献重要力量。